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구글 딥마인드, 질병 원인 찾는 AI '알파게놈 2' 공개

구글 딥마인드가 질병 원인으로 의심되는 DNA 변화를 찾아내는 인공지능(AI)을 공개했다. DNA 변화가 몸속 어느 세포에 영향을 주는지 예측해 질병 원인을 밝힐 실마리를 제시한다. 구글 딥마인드는 11일(현지시간) 공식 블로그를 통해 유전체 분석 모델 '알파게놈 2'를 발표했다. 사람과 생쥐에서 얻은 세포 자료 1억 700만 개 이상 등을 학습해 DNA 변화가 유전자 활동에 미치는 영향을 예측한다. 우리 몸의 세포는 대체로 같은 DNA를 갖고 있지만 사용하는 유전자는 다르다. 같은 설명서를 갖고 있어도 맡은 일에 따라 필요한 부분을 읽는 방식이다. 심장 근육 세포와 감염에 대응하는 면역 세포가 서로 다른 일을 하는 이유다. 이 때문에 DNA 일부가 달라지는 '변이'도 세포에 따라 다른 영향을 줄 수 있다. 특정 면역 세포에서만 유전자 활동을 바꾸는 변이라면 여러 세포가 섞인 조직을 분석할 때는 그 영향을 발견하기 어렵다. 알파게놈 2는 이런 차이를 구분하도록 개발했다. 기존 모델이 조직에서 평균적으로 나타나는 반응을 예측했다면 새 모델은 특정 세포 종류와 상태에 맞춰 분석한다. 연구자가 DNA 정보와 살펴볼 세포 조건을 입력하면 모델은 어떤 유전자 활동이 늘거나 줄어들지 예측한다. 연구자는 이 결과를 바탕으로 질병 원인을 확인할 후속 실험을 설계할 수 있다. 구글은 면역 세포 28종을 다룬 평가에서 성능 향상을 확인했다고 설명했다. 유전자 활동을 바꾸는 원인 변이를 찾아낸 비율은 30%였다. 개별 세포 자료를 추가 학습한 기존 알파게놈의 16%보다 높았다. 대표 사례는 염증성 장질환 연구다. 앞선 연구에서는 특정 DNA 변이가 장내 면역 세포인 대식세포에서 'ETS2' 유전자를 지나치게 활성화해 질병을 일으키는 과정을 밝혔다. 알파게놈 2는 이 결과를 계산으로 재현했다. 해당 변이가 다른 세포와 유전자에는 큰 영향을 주지 않으면서 장내 대식세포에서 ETS2 활동을 높인다고 예측했다. 질병과 관련된 DNA 변화뿐 아니라 그 변화가 작용하는 세포도 찾아낸 사례다. 새로운 세포 상태를 분석할 때 모델을 다시 학습시킬 필요도 없다. 연구자가 수십 개 세포에서 측정한 유전자 활동 자료를 입력하면 이를 바탕으로 예측한다. 질병이나 백신 접종으로 평소와 달라진 세포 상태도 살펴볼 수 있다. 구글은 코로나19 mRNA 백신 연구 자료로 이 기능을 시험했다. 모델은 백신에 반응한 면역 T세포와 휴식 상태인 T세포를 구분했다. 중증 코로나19와 관련된 DNA 변이가 백신에 반응한 세포에서 유전자 활동을 더 크게 바꾼다고 예측했다. 같은 변이라도 세포 상태에 따라 영향이 달라진다는 설명이다. 연구자가 바로 참고할 수 있는 분석 자료도 마련했다. 구글은 여러 질병과 신체 특징에 관련된 DNA 변이가 수백 가지 세포·조직 조건에서 어떻게 작용할지 미리 계산했다. 연구자는 직접 대규모 계산을 하지 않고도 조사할 유전자와 세포를 선정하는 데 이 자료를 활용할 수 있다. 알파게놈 2는 이날부터 비상업 연구에 사용할 수 있다. 상업 연구용은 일부 이용자에게 먼저 제공한다. 구글은 연구용 모델이며 환자 진단이나 임상 목적으로 검증·승인받지는 않았다고 명시했다. 휴먼 셀 아틀라스 공동 설립자인 사라 타이히만 케임브리지대 교수는 "알파게놈 2는 추가 학습 없이 새로운 단일 세포 자료에 바로 적응한다"며 "적은 수의 세포 표본으로도 새롭게 관찰한 세포 상태에서 DNA 변이가 어떻게 작용하는지 예측한다"고 평가했다.

2026.11.12 09:46김동원 기자

[AI는 지금] 구글딥마인드, DNA 변이 90억개 AI로 분석…"질병 원인 신속히 찾아"

구글딥마인드가 질병 관련 유전적 변이를 빠르게 찾아내 생명과학 연구·치료법 개발을 앞당길 수 있는 인공지능(AI) 플랫폼을 내놨다. 구글딥마인드는 약 90억개 DNA 변이가 인체 분자생물학적 작용에 미치는 영향을 정리한 '알파게놈 아틀라스'를 8일(현지시간) 홈페이지를 통해 공개했다. 연구자는 이날부터 웹사이트를 통해 비상업적 연구 목적으로 이를 이용할 수 있다. 알파게놈 아틀라스는 인간 게놈을 구성하는 특정 염기가 다른 염기로 바뀔 때 발생할 수 있는 변화를 예측할 수 있다. 특정 단백질 생성량이 달라지는지를 비롯해 각 변이가 인체에 미칠 수 있는 영향을 분자 수준에서 제시한다. 인간 DNA는 아데닌(A)과 사이토신(C), 구아닌(G), 티민(T) 등 네 가지 염기로 구성된다. 인간 게놈에는 약 30억쌍의 염기가 있으며 이 가운데 하나만 바뀌어도 개인 특성이나 질병 발생에 영향을 줄 수 있다. DNA를 구성하는 약 30억개 위치의 염기는 각각 다른 세 가지 염기로 바뀔 수 있다. 이 때문에 발생할 수 있는 단일 염기 변이는 약 90억개에 달한다. 알파게놈 아틀라스는 이런 변이가 인체에 미칠 영향을 AI로 미리 계산해 정리할 수 있다. 연구자는 이를 활용해 수많은 변이 중 질병과 관련됐을 가능성이 큰 변이를 먼저 찾아볼 수 있다. 딥마인드는 연구할 가치가 높은 변이를 쉽게 가려낼 수 있도록 '변이 영향 점수'도 공개했다. DNA 변화가 인체에 미치는 영향을 점수로 나타내 변이 중요도와 작용 방식을 함께 파악하도록 돕는다. 알파게놈 아틀라스는 딥마인드가 지난해 공개한 AI 모델 '알파게놈'으로 구축됐다. 알파게놈은 인간과 생쥐의 공개 게놈 데이터를 학습해 DNA 변화가 생명 활동에 어떤 영향을 주는지 예측한다. 기존 AI 모델 '알파미센스'가 단백질을 변화시킬 가능성이 있는 일부 돌연변이를 분석했다면 알파게놈 아틀라스는 예측 범위를 인간 게놈 전체로 넓혔다. 단백질 생성에 필요한 정보를 직접 담고 있지 않은 '비암호화 영역'도 분석 대상에 포함했다. 비암호화 영역은 단백질을 직접 만들지는 않지만 유전자가 언제 어디에서 얼마나 작동할지를 조절한다. 인간 게놈 대부분을 차지하는 만큼 이 영역 변화를 분석하면 질병이 발생하는 과정을 이해하는 데 도움을 받을 수 있다. 딥마인드는 알파게놈을 활용해 약 90억개 변이의 영향을 미리 계산했다. 이를 모은 알파게놈 아틀라스의 전체 데이터 규모는 약 1페타바이트에 달한다. 연구자는 웹 포털과 구글의 AI 개발 플랫폼 '안티그래비티' 또는 알파게놈 인터페이스를 통해 예측 결과를 확인할 수 있다. 비상업적 연구에는 이날부터 이용할 수 있으며 상업용 서비스는 조만간 구글클라우드를 통해 제공될 예정이다. 지가 아브세크 구글딥마인드 유전체학 총괄은 "변이 범위가 워낙 방대하기 때문에 이렇게 많은 변이를 사전에 계산하고 분석하는 데 상당한 시간이 필요했다"며 "알파게놈 아틀라스는 과학과 의학 분야 난제를 AI로 풀려는 우리 연구 연장선에 있다"고 홈페이지에서 밝혔다.

2026.09.09 09:59김미정 기자

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